Inspektorat Jendral sebelum melakukan pemeriksaan, telah melakukan pre audit meeting sehari sebelumnya dan dihadiri oleh jajaran struktural IAIN Ponorogo pada hari Jumat 23 April 2021. Audit sendiri dimulai pada hari Senin, 26 April 2021 di lantai 1 gedung Rektorat IAIN Ponorogo.
Berkas yang diperlukan telah disiapkan unit kerja dan tertata di ruang audit, kepala SPI ikut mendampingi dari hari Jumat hingga berakhirnya audit dengan diadakannya expose oleh pihak Inspektorat Jendral. Pendampingan yang dilakukan kepala SPI diantaranya adalah wawancara secara berkala baik di ruang audit maupun di ruang SPI dengan fokus kinerja dosen dan tenaga pendidik.
Hasil penelusuran ditemukan beberapa dosen yang belum mengumpulkan kewajiban laporannya, untuk itu tim audit yang dipimpin bapak Farid meminta melakukan penelusuran mengenai keberadaan dosen. Dari hasil penelusuran ditemukan dosen yang tidak maksimal dalam kinerjanya, sebagai contoh tidak mengisi absensi. Pada hari berikutnya Inspektorat Jendral di damping kepala SPI IAIN Ponorogo melakukan kunjungan audit kinerja ke 4 fakultas yakni FATIK, FUAD, FEBI serta FASYA.
Setelah melakukan kunjungan ke fakultas, sebelum penutupan audit yang dilakukan oleh Ispektorat jendral, dilakukan expose hasil temuan di ruang audit yang dihadiri oleh pejabat structural IAIN Ponorogo.
Setelah hasil temuan dan rekomendasi yang dipaparkan oleh tim audit, maka dinyatakan bahwa audit yang digelar di IAIN Ponorogo telah selesai dan ditutup.